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員工請假扣款會計分錄：
借：庫存現金(銀行存款)
貸：營業外收入
或
從工資中扣除：
借：應付職工薪酬
貸：營業外收入
職工薪酬，是指企業為獲得職工提供的服務或解除勞動關系而給予的各種形式的報酬或補償。職工薪酬包括短期薪酬、離職后福利、辭退福利和其他長期職工福利。企業提供給職工配偶、子女、受贍養人、已故員工遺屬及其他受益人等的福利，也屬于職工福利。
“職工”是指與企業訂立勞動合同的所有人員，含全職、兼職和臨時職工，也包括雖未與企業訂立勞動合同但由企業正式任命的人員。未與企業訂立勞動合同或未由其正式任命，但向企業所提供服務與職工所提供服務類似的人員，也屬于職工的范疇，包括通過企業與勞務中介公司簽訂用工合同而向企業提供服務的人員。
應付職工薪酬是企業根據有關規定應付給職工的各種薪酬。應付職工薪酬是企業會計科目中負債類科目之一。相關賬務處理如下：
1、企業按照有關規定向職工支付工資、獎金、津貼等，借記"應付職工薪酬"，貸記“銀行存款”、“庫存現金”等科目。
2、企業從應付職工薪酬中扣還的各種款項(代墊的家屬藥費、個人所得稅等)，借記本科目，貸記“其他應收款”、“應交稅費——應交個人所得稅”等科目。
3、企業向職工支付職工福利費，借記本科目，貸記“銀行存款”、“庫存現金”科目。
4、企業支付工會經費和職工教育經費用于工會運作和職工培訓，借記本科目，貸記“銀行存款”等科目。
5、企業按照國家有關規定繳納社會保險費和住房公積金，借記本科目，貸記“銀行存款”科目。
6、企業因解除與職工的勞動關系向職工給予的補償，借記本科目，貸記“銀行存款”、“庫存現金”等科目。
員工遲到扣款如何做會計分錄
1.以罰款通知做分錄
借：其他應收款
貸：營業外收入
2.發工資扣除時
借：應付職工薪酬
貸：其他應收款
3.做工資分錄時，先計入往來
借：管理費用
貸：應交稅費-個稅
貸：其他應付款-罰款
貸：庫存現金
然后再按照罰款的性質，再從往來轉入或沖減相關科目。
想全面掌握員工請假扣款會計分錄，了解更多相關內容可查看短期薪酬的核算。